В центре сюжета кинокартины «Мятежники» — юная Настя, которой органы опеки лишают мать родительских прав. Девочка попадает в специализированный интернат для детей с различными особенностями психического и физического развития. Однако в этих стенах печальная и молчаливая Анастасия находит настоящий дом и верных друзей.

Педагог Галина Захарьевна, возглавляющая учреждение, искренне старается заменить детям маму. Благодаря заботе этой добросердечной женщины, Настя начинает чувствовать себя полноценной частью дружной семьи. Но вскоре их мир оказывается под угрозой из-за беспринципного и алчного предпринимателя, который планирует построить масштабный коммерческий комплекс, разрушив здание интерната. Корыстные чиновники активно поддерживают его намерения.

Тем не менее, дети не хотят расставаться с близкими друзьями и попадать в разные приюты. После просмотра постановки о бесстрашной Жанне д'Арк, они под руководством мужественной Галины Захарьевны решают всеми силами бороться с несправедливостью и отстоять свой дом.